Here are some possibilities from a quick internet search:
Уютная 2-х комнатная квартира
по часам,суткам,неделям м.К Маркса
ул.Римского корсакова,д.4
2500т.р за сутки
предоставляем документы для отчёта.
тел:214-96-32
Ask for Tatyana. Around $82 per night. She will help with visa registration if you ask.
Сдам 1-2к квартиры м.К Маркса, м.Студенческая
часы,сутки,недели
от 1300р - 3200р в сутки
предоставляем документы для отчёта
тел: 214-96-32, 8-961-215-99-09
Сдам 1к в кировском р-не, ул. Сибиряков-Гвардейцев, д. 40.
4/5 кирпич, в квартире есть все необходимое, 15 минут до метро пл. К.Маркса
Стоимость 18 000 (торг) + электричество и вода по счетчику
т.8-913-781-19-90
$60 per night, ask for Evgeniy
Сдам посуточно 1-к квартиру в центре Новосибирска рядом с ж/д вокзалом. Метро рядом. 7 этаж. Общая площадь 39 кв. м. В квартире есть все для комфортного проживания, сделан ремонт. Для командированных предоставляются отчетные документы (форма 3Г+чек). Цена за проживание: от 2 до 5 суток – 1600 руб., более 5 суток – 1500 руб. за сутки.
Тел. 89139459971
Ask for Natalia, prices from 1 day or up to 30 days, around $65 per day.
1к квартира посуточно в самом центре Новосибирска
Адрес: Ядринцевская, 18
Квартира элит класса. В квартире двуспальная кровать, телевизор, шкаф, встроенная кухня, душевая кабина. WI FI, Кабельное ТВ. Микроволновка, Стиральная машинка
Ориентир: пл. Ленина. Театр Оперы и балета, центральный парк
тел. 8 923 183 33 69, ask for Natalia

Other sources for short-term Novosibirsk rentals:http://ns.sutochno.ru/http://miete.su/Novosibirskhttp://arenda.ngs.ru/www.airbnb.com (English)
When looking for rentals the single biggest mistake visitors make is to make a Google search in English. There all the rental agents will have you convinced that the only kind of quality apartment is at least $5000 per month on a lease; or the bevy of expats
taking care of their countrymen for $250+ per day. Search in Russian and you'll discover normal people renting nice apartments, even in Moscow, plenty at under $100 per day.
When looking at a listing there is a quick way to tell if the rental is daily or only on contract (lease) for months at a time. When you see:
сут (or сутки) = An owner only uses сут if they're willing to rent it for a few days or weeks at a time. Example: if you see 1800p сут. then you'll know that the apartment can be rented short term and the daily rent is $60 per day.
мес. = abbreviation for months. This is a long term rental and unless you are moving there to live for awhile you should move on to the next listing.
час. = is literally the word for "hour." You won't see this one often, but you know what it means if you do.
How to convert Rubles into Dollars or Euros:
www.xe.comSome of the important questions to ask will include:- Is wifi included?
- How close is the Metro?
- Is there a nearby bus, trolley or tram stop?
- Are there any food markets close by?
- Is the weekly cleaning included?
- Is there a wash machine for clothing?
- Can more than one person can stay at this price?
- How do I contact you if there is a problem in the apartment, can't remember the door code, operate the washer, etc, ?